Bayesian approach to comparing substrates in cupuaçu seedlings

Authors

Keywords:

Theobroma grandiflorum, anova, linear model, MCMC, OpenBUGS

Abstract

The objective of this work was to verify the influence of seven different substrates with four varieties of Theobroma grandiflorum, through the Bayesian approach. The experiment was carried out in Belém, PA, Brazil, in a completely randomized design, with a 7 × 4 factorial arrangement and five replicates. The following variables were analyzed: total mass (g) and total dry matter mass (g). For the Bayesian analysis, uninformative priors were considered for parameters. Were generated by the Gibbs sampler, two chains of size 110,000 with 10,000 initial iterations discarded, and to ensure the independence, was considered a spacing between the sampled points of ten iterations. The convergence of the chains was checked using the criteria of Geweke and Gelman & Rubin, available at R package BOA. For selecting the best model, we used the DIC criterion, which indicated that the most parsimonious model for both variables, features beyond the average, the effects of substrate, variety and interaction between them.

Author Biographies

Vinicius Silva dos Santos, Universidade Federal de Viçosa

Sebastião Martins Filho, Universidade Federal de Viçosa

Rafael Moysés Alves, Embrapa Amazônia Oriental

Gerlane de Freitas Melo, Universidade Federal Rural da Amazônia

References

ANDRADE, P. C. R.; FERREIRA, D. F. Comparações múltiplas bayesianas em modelos normais homocedásticos e heterocedásticos. Ciência e agrotecnologia, Lavras, v.34, n.4, p.845-852, 2010.

BOX, G. E. P.; TIAO, G.C. Bayesian inference in statistical analysis. New York: John Wiley. 1992. 588p.

KIST, B. B.; VENCATO, A. Z.; SANTOS, C.; CARVALHO, C.; REETZ, E. R.; POLL, H.; BELING, R. R. Anuário Brasileiro da Fruticultura. Santa Cruz do Sul: Gazeta Santa Cruz. 2012. 128p.

LUNN, D., SPIEGELHALTER, D., THOMAS, A.; BEST, N. The BUGS project: Evolution, critique and future directions. Statistics in Medicine, v.28, n.25, p.3049-3067, 2009.

MARTINS FILHO, S.; SILVA, F. F.; CARNEIRO, A. P. S.; MUNIZ, J. A. Abordagem bayesiana das curvas de crescimento de duas variedades de feijoeiro. Ciência Rural, Santa Maria, v.38, n.6, p.1516-1521, 2008.

NOGUEIRA, D. A.; SAFÁDI, T.; FERREIRA, D. F. Avaliação de critérios de convergência para o método de Monte Carlo via Cadeias de Markov. Revista Brasileira de Estatística, Rio de Janeiro, v.65, n.224, p.59-88, 2004.

NTZOUFRAS, I.; Bayesian Modeling Using WinBugs. New York: John Wiley & Sons. 2009. 506p.

PEREIRA, J. M.; MUNIZ, J. A.; SÁFADI, T.; SILVA, C. A. Comparação entre modelos para predição do nitrogênio Mineralizado: uma abordagem bayesiana. Ciência e agrotecnologia, Lavras, v.33, p.1792-1797, 2009.

REIS, R. L.; MUNIZ, J. A.; SILVA, F. F.; SÁFADI, T.; AQUINO, L. H. Abordagem bayesiana da sensitividade de modelos para o coeficiente de endogamia. Ciência Rural, Santa Maria, v.39, n.6, p.1752-1759, 2009.

ROSSI, R. M.; GASPARINI, D. C. S. O uso de procedimentos estatísticos para comparação da produção de ovos considerando diferentes tratamentos e linhagens de codornas. Semina, Londrina, v.33, n.1, p.17-26, 2012.

SECRETARIA DE AGRICULTURA DO ESTADO DO PARÁ. A fruticultura no Estado do Pará. Disponível em: http://www.sagri.pa.gov.br/. Acesso em: 17 de fevereiro de 2014.

SANTOS, V. S.; MELO, G. F.; ALVES, R. M. Produção de mudas orgânicas de cupuaçuzeiro no estado do Pará. In: 21° Congresso Brasileiro de Fruticultura. Anais. CD-DVD. Natal: SBF, Sociedade Brasileira de Fruticultura, 2010.

SMITH, B. J. boa: An R Package for MCMC Output Convergence Assessment and Posterior Inference. Journal of Statistical Software, v.21, n.11, p.1-37, 2007.

Published

17-01-2015

How to Cite

Santos, V. S. dos, Filho, S. M., Alves, R. M., & Melo, G. de F. (2015). Bayesian approach to comparing substrates in cupuaçu seedlings. Sigmae, 2(3), 107–114. Retrieved from https://publicacoes.unifal-mg.edu.br/revistas/index.php/sigmae/article/view/241